Устойчивость возбудителя covid 19 тест

Точность ПЦР тестов

Проблема ОТ-ПЦР в реальном времени ― риск получения ложноотрицательных и ложноположительных результатов. Многие «подозреваемые» случаи с типичными клиническими характеристиками COVID-19 и идентичными специфическими изображениями компьютерной томографии (КТ) не были диагностированы ПЦР тестированием. Т.е. отрицательный результат не исключает заражения COVID-19 и не должен использоваться в качестве единственного критерия для принятия решений о лечении или ведении пациента. В то же время, при отрицательном результате, стоит о задуматься о возможности заражения каким-либо другим вирусом.

Ложноотрицательные результаты могут быть получены из-за мутаций в геноме SARS-CoV-2. Попытка разработать анализ ОТ-ПЦР в реальном времени как можно точнее, может привести к снижению эффективности анализа и потенциальному ложным отрицательном результатам. Несколько типов наборов для ОТ-ПЦР в реальном времени SARS-CoV-2 были разработаны и быстро одобрены, но с разным качеством.

Чувствительность и специфичность самого качественного теста ОТ-ПЦР в реальном времени не составляет 100%.

Ложноположительным результатам сильно способствует процедура отбора проб. Наиболее точным образцом для лабораторной диагностики COVID-19 является мокрота, за ней следуют мазки из носа. Мазки из зева не рекомендуются для диагностики.

Отбор проб для ПЦР

Сбор образцов, таких как мокрота, мазок из носа и мазок из горла, является быстрым, простым и безопасным. Образцы должны быть получены с помощью тампонов из дакрона или полиэстера и должны быть как можно быстрее доставлены в лабораторию. На получение результатов нужно от 24 до 48 часов.

Точность результатов ПЦР-теста на коронавирус очень сильно зависит от соблюдения процедуры отбора проб, скорости доставки проб в лабораторию и качества реактивов.

В случае отрицательного результата ПЦР, но с подозрением на клинические признаки COVID-19 используют несколько типов образцов в разные моменты времени. Сочетание ОТ-ПЦР, клинических характеристик и изображения КТ облегчает диагностику и лечение заболевания.

НЕ СОБЛЮДЕНЫ ПОСТУЛАТЫ КОХА

Кроме того, нет научных доказательств того, что эти последовательности РНК являются возбудителем того, что называется COVID-19.

Чтобы установить причинную связь, так или иначе, то есть помимо выделения и очистки вируса, было бы абсолютно необходимо провести эксперимент, который удовлетворял бы четырем постулатам Коха. 

1. Микроорганизм/вирус постоянно встречается в организме больных людей (или животных) и отсутствует у здоровых.
2. Микроорганизм/вирус должен быть изолирован от больного человека (или животного) и его штамм должен быть выращен в чистой культуре.Чтобы только выделить его каждый раз нужны огромные средства.
3. При заражении чистой культурой микроорганизма/вируса здоровый человек (или животное) заболевает. Кто это делал: заражал людей, да никто, это невозможно. А животные не дадут четкой картины.
4. Микроорганизм/вирус должен быть повторно изолирован от экспериментально заражённого человека (или животного).

Но такого эксперимента нет и не было, как недавно рассказали Эмори Деверо и Розмари Фрей.

Одним из примеров является исследование, опубликованное в журнале Nature 7 мая . Это испытание, помимо других процедур, делающих исследование недействительным, не соответствовало ни одному из постулатов.

Например, у предполагаемых «инфицированных» лабораторных мышей не было выявлено каких-либо значимых клинических симптомов, явно связанных с пневмонией, которая, согласно третьему постулату, должна действительно возникнуть, если там действительно бы действовал опасный и потенциально смертельный вирус. А легкая взерошенность и потеря веса, которые временно наблюдались у животных, незначительны не только потому, что они могли быть вызваны самой процедурой укола неизвестным организму веществом, но также итот факт. что вес снова вернулся к норме.

Показательно, что ни один из ведущих немецких представителей официальной теории SARS-Cov-2 / COVID-19: — Институт Роберта Коха (RKI), Александр С. Кекуле (Университет Галле), Хартмут Хенгель и Ральф Бартеншлагер (Немецкое общество) по вирусологии), вышеупомянутые Томас Лёшер, Ульрих Дирнагл (Шарите Берлин) или Георг Борнкамм (вирусолог и почетный профессор Гельмгольц-центра Мюнхена) — могли бы ответить на следующий вопрос, который им отправили:

Если частицы, которые, как утверждается, принадлежат к SARS-CoV-2, не были очищены, как вы хотите быть в этом уверены, что последовательности генов РНК этих частиц принадлежат конкретному новому вирусу?

В частности, если есть исследования, показывающие, что вещества, такие как антибиотики, которые добавляются в пробирки в экспериментах in vitro, проводимых для обнаружения вирусов, могут «подвергать стрессу» культуру клеток таким образом, что образуются новые последовательности генов, которые ранее не были обнаружены — как аспект, на который лауреат Нобелевской премии Барбара МакКлинток уже обращала внимание в своей Нобелевской лекции еще в 1983 году . Но мы не получили ответов до 18 июня 2020 года, после нескольких месяцев отсутствия ответа. В конце концов, мы добились этого только с помощью берлинского юриста Вивиан Фишер

Но мы не получили ответов до 18 июня 2020 года, после нескольких месяцев отсутствия ответа. В конце концов, мы добились этого только с помощью берлинского юриста Вивиан Фишер.

Шарите признает, что они не использовали очищенные частицы.

Вирусологи из клиники Шарите заявляют:

Это означает, что они просто предположили, что РНК была вирусной .

Между прочим, Corman et al. Документ, опубликованный 23 января 2020 года, даже не прошел надлежащего процесса рецензирования, и описанные в нем процедуры не сопровождались контролем — хотя только благодаря этим двум вещам научная работа становится действительно научной.

Диагностика

Диагностика коронавирусной инфекции включает:

• осмотр, выслушивание легких, оценку жалоб;
• уточнение информации о возможных источниках заражения (перелет из Китая, контакт с потенциально больными и т. д.);
• проведение лабораторных тестов и инструментальных обследований.

Поскольку коронавирус SARS-CoV-2 вызывает такую же симптоматику, что и другие респираторные вирусы, требуются дополнительные высокоточные методики для подтверждения этиологии заболевания. Одним из наиболее достоверных тестов считают полимеразную цепную реакцию (ПЦР), которую уже рекомендовала Всемирная организация здравоохранения.

Среди инструментальных методов решающее значение принадлежит компьютерной томографии, позволяющей точно определить наличие и масштаб легочных поражений. На КТ больных коронавирусом обнаруживают своеобразные легочные инфильтраты, напоминающие матовое стекло.

Характеристики и структура SARS-CoV-2

Вирион коронавируса SARS-CoV-2, как и большинство других Coronaviridae имеет шарообразную форму, с нуклеокапсидом и РНК внутри, а снаружи покрытым жировой (липидной) оболочкой. Длина РНК составляет до 30 000 нуклеотидов в последовательности, где также присутствуют нетранслируемые участки длиной 281 и 325 нуклеотида. Из липидной оболочки выступают булавовидные пепломеры гликопротеин S, гемагглютинин-эстераза (НЕ), белки М, Е.

Устойчивость во внешней среде

Согласно исследованиям2 итальянских ученых Filippo Ansaldi, P Morelli и прочих, капсид коронавируса (SARS-CoV), как и вируса группы А (Influenza A virus) повреждается при контакте с этанолом (70%), хлоргексидином (1%), гипохлоритом натрия (0,01%), что препятствует его дальнейшей репликации.

Другие дезинфекторы, которые убивают коронавирус в течение 1 минуты — этанол (80% и более), изопропанол (45%), н-пропанол (30%), мезетрония этилсульфат (0,2%).

Вирус разрушается на поверхности в случае воздействия на него температуры +33 °С в течение 16 часов, или +56 °С, в течение 10 минут.

Также инфекция разрушается при воздействии ультрафиолетовых лучей в течение 2-15 минут, это в случае обработки поверхности УФ-облучением от кварцевых ламп.

В воде коронавирусы способны сохранять свою активность в течение 9 суток. Столько же времени инфекция живет при комнатной температуре (около 22 °С) на следующих поверхностях — пластик, металл, стекло, бумага.

При охлаждении до +4 °С, особенно на фоне высокой влажности или замораживании температурой в −70 °С — в течение нескольких лет.

Причины

Первоисточником инфекции были летучие мыши, однако, на сегодняшний день, главный источник (резервуар) SARS-CoV-2 – инфицированные люди.

Согласно исследований1 группы греческих врачей D.Paraskevis, G.Magiorkinis и прочих, новый коронавирус SARS-CoV-2 на 96,3% генетически схож на коронавирус летучих мышей BatCoV «RaTG13», что наталкивает на первопричину заражения человека.

Заражение коронавирусом SARS-CoV-2 происходит следующими путями:

• Воздушно-капельный (аэрогенный) – переносится с потоками воздуха, особенно если вблизи находится чихающий или кашляющий носитель инфекции. Также, микрокапельки носителя при кашле или чихании могут попадать на разные поверхности, после контакта с которыми здоровый человек может прикоснуться к глазам, рту и другим частям лица и также заболеть;
• Фекально-оральный путь (алиментарный) – инфекция во внешнюю среду попадает из ЖКТ, а после через зараженную воду или продукты вновь в организм человека.
• Контактно-бытовой – заражение происходит при использовании предметов гигиены или личных больного, особенно в случае контакта грязных вещей со слизистыми или открытыми ранами здорового человека.

В группу риска входят:

• Медперсонал;
• Лица, проживающие в плохих санитарных условиях;
• Лица с ослабленным иммунитетом;
• Лица, употребляющие в пищу змей, летучих мышей и других экзотических животных.

Заразность

Контагиозность (заразность) нового китайского коронавируса по отношению к другим вирусным инфекциям составляет:

• R0 Вирусы гриппа Influenzavirus — 1-2;
• R0 Коронавирус SARS-CoV-2 — 3,3-3,5;
• R0 Вирус кори Measles morbillivirus — 12-18.

R0 — базовое репродуктивное число, т.е. количество людей, которых носитель инфекции способен заразить вокруг себя.

Исходя из вышеперечисленных данных можно сделать вывод, что SARS-CoV-2 в 3 раза заразнее гриппа, но в тоже самое время в 4-5 раз менее заражен кори.

Классификация SARS-CoV-2

Активные исследования продолжаются, однако, на 27 января достоверно известны 26 генома SARS-CoV-2, а в марте их число увеличилось до 103.

В целом, уханьский коронавирус склонен к мутированию. Так, ученые выявили склонность SARS-CoV-2 к эволюционированию, поэтому, на март уже обнаружено 149 изменений в его штамме. Кроме того, новый коронавирус разделили на 2 подтипа — «L» и «S». Подтип «L» являлся первоначальной формой SARS-CoV-2, обнаруженной в Ухане, и его доля у больных составляет до 70%. Подтип «S» появился позже, является менее агрессивен и встречается примерно в 30% больных.

Штаммы коронавируса SARS-CoV-2

Наиболее популярными штамами являются:

«VUI-202012/01» — новый штамм коронавируса из Великобритании, или как его еще называют новый «Британский штамм», вызывающий COVID-19. Согласно последним данным, является на 70% более заразным, по сравнению с обычным, распространенным по всему миру штамом, терзающий людей с конца 2019 года

У «Британского коронавируса» выявлено 17 мутаций, но наиболее важной, которая и вызывает большую активность по проникновению в клетку «жертвы» является мутация N501Y в белке-шипе, использующийся для связывания в рецептором ACE2 человека. Именно из-за высокой заразности VUI-202012/01 на данный момент очень быстро вытесняет другие штаммы

Тем не менее, как заявляют вирусологи, против VUI-202012/01 вакцина будет также действенной.

Лечение коронавируса SARS-CoV-2 (2019-nCoV)

Оптимальную схему лечения нового коронавируса SARS-CoV-2 (заболевание COVID-19) врачи различных стран все еще разрабатывают. Некоторые ученые, например в Японии утверждают, что уже нашли сыворотку от данного вируса.

Однако, пока специфические противовирусные препараты разрабатываются, все сходятся во мнении, что прежде всего терапия должна быть направлена на поддержание функций жизненно-важных органов, т.е. применяется симптоматическое лечение.

1. Медикаментозное лечение

Министерство Здравоохранения РФ 03.02.2020 г. опубликовало временные методические рекомендации по лечению вирусной инфекции COVID-19, в которой указаны следующие противовирусные препараты против этого вируса – «Рибавирин», «Лопинавир/Ритонавир», «Рекомбинантный интерферон бета-1b».

Для контроля за температурой тела- если она повышается до критических отметок (40 °С и выше) или не проходит в течение нескольких дней, держась на уровне 38,5 °С у взрослых и 38 °С у детей, применяются жаропонижающие лекарства — «Парацетамол».

В начале вспышки болезни применяли лекарства из группы нестероидные противовоспалительные препараты (НПВС) – «Ибупрофен», «Нурофен», «Нимесил» и прочие, однако от них выявлен эффект усиления течения болезни и появления осложнений, поэтому Ибупрофен и прочие средства при лечении КОВИД-19 запрещен.

При средне-тяжелом и тяжелом поражении проводится дезинтоксикационная терапия, целью которой является очищение организма, в частности, крови от продуктов инфекционного поражения, состоящих из самих микробов, а также продуктов их жизнедеятельности в организме. Для детоксикации организма применяются растворы глюкозы («Декстроз»), электролитов (полиионные растворы), «Декстран», растворы кристаллоидов, «Гидрокарбоната натрия». После этих средств применяются диуретики (мочегонные средства) – «Фуросемид», «Маннитол».

Применение диуретиков также способствует снижению отечности в легких, частично профилактируя тем самым обструкцию дыхательных путей.

При сильном насморке и заложенности носа, выраженной отечности носовых ходов назначаются сосудосуживающие капли — «Фармазолин», «Отривин», «Нокспрей» и прочие.

При нарушении дыхательной функции применяют ИВЛ (искусственная вентиляция воздуха), а при необходимости делают интубацию трахеи.

Китайские медики также с успехом испробовали лечить пневмонию, вызванную SARS-CoV-2 экстракорпоральной оксигенацией, суть которого заключается в искусственном насыщении крови кислородом, тем самым улучшив дыхательную функцию организма.
Гормональные препараты (глюкокортикостероиды) при COVID-19 в отличие от пневмонии, вызванной SARS-CoV-1 и MERS-CoV применять не рекомендуется, т.к. замечен незначительный результат по снятию воспалительного процесса, но, в это же время, гормоны замедляли действие иммунитета по купированию нового коронавируса.

Антибиотики против вирусной инфекции также не назначаются, поскольку они не обладают против них никаким пагубным действием, а вот дополнительно понизить реактивность иммунитета при их применении вполне возможно. Назначение антибактериальных препаратов целесообразно лишь при вторичной бактериальной инфекции.

2. Диета при COVID-19

Цель диетического питания при коронавирусах – поддержать организм и аккумулировать его силы на борьбу с инфекцией.

При ОРВИ, пневмонии и других инфекционных заболеваниях дыхательной системы назначается диета №13 (стол №13).

При данной диете не рекомендуется к употреблению жирного, острого, жаренного, копченостей, крепкого чая, кофе, и конечно же, алкогольной продукции.

Подготовка к диагностике

Для получения достоверных результатов важно соблюдать правила подготовки к забору биоматериала. Перед мазком из зева и носа нельзя кушать, чистить зубы, курить и жевать резинку в течение 2 часов, на протяжении последних 30 минут не пить воду

Также на протяжении последних 2 часов рекомендуют не использовать капли/спреи в нос, горло. Если наблюдается большое количество вязкого секрета, то перед проведением мазка нужно высморкаться.

Забор венозной крови проводят утром натощак либо не ранее, чем через 6-8 часов с момента последнего приема пищи. Пить воду на протяжении этого времени можно. Если пациент принимал в течение 2 последних недель препараты, влияющие на состояние иммунной системы (Амиксин, Тилорон-С3), необходимо сообщить об этом лаборанту. Тот сделает соответствующие пометки на бланке анализа.

Лечение коронавирусной инфекции

Никакого специфического лечения коронавирусной инфекции на сегодняшний день не существует. Попытки использования противовирусных средств в большинстве случаев несут больше вреда нежели пользы. Эти препараты обладают побочными эффектами: обостряют хронические болезни, приводят к патологии крови и т. д. Такое «лечение» может погубить человека и без коронавируса.

20 ноября ВОЗ выпустила рекомендации, в которых не рекомендует применять ремдесивир, независимо от тяжести заболевания, так как в настоящее время нет доказательств эффективности препарата . Однако уточняющие испытания ещё продолжаются .

Лопинавир, и другие ингибиторы ВИЧ, которые используются для антиретровирусной терапии при ВИЧ-инфекции, показали некоторое действие в борьбе с коронавирусом в пробирке, но при испытании на людях оказались неэффективны и опасны (обладают серьёзными побочными эффектами в тех дозах, которые необходимы для минимального влияния на вирусные частицы). В стандартных случаях эти препараты не используются — их применение возможно только в условиях испытаний и строго под контролем врача

На данный момент препараты для лечения ВИЧ-инфекции, а также хлорохин и гидроксихлорохин, ивермектин в мировой практике при лечении коронавируса, в т. ч. тяжёлых форм заболевания, признаны неэффективными и не рекомендуются .

Большинство случаев течения коронавирусной инфекции не нуждается в какой-либо медикаментозной терапии. Больным лёгкими и среднетяжёлыми формами болезни (в т. ч. и новой COVID-19) требуется лишь в покой (домашний режим без выхода на улицу минимум на 7 дней), отдых, рациональное питание (не переедать, не заставлять себя есть через силу) и обильное тёплое питьё (вода, морс, компоты). Воздух в помещении спальни, где находится больной, должен быть умеренно прохладным (18-20°С) и влажным (40-60 %). Это позволяет не пересушивать слизистую респираторного тракта, сохраняя её иммунологическую и очищающую функции. При наличии кашля применяются отхаркивающие и разжижающие мокроту средства, при першении в горле — полоскания и орошения растворами антисептиков.

При тяжёлых формах болезни (в основном COVID-19) и потенциально высоком риске осложнений (у пожилых людей с сопутствующими заболеваниями, иммунодефицитных больных и людей с сахарным диабетом, онкологией, сердечно-сосудистой и бронхолёгочной патологией) показана госпитализация в инфекционный стационар, оснащённый аппаратами искусственной вентиляции лёгких и средствами неотложной терапии. При развитии сопутствующей бактериальной пневмонии или других осложнений показано назначение антибиотиков (при коронавирусной инфекции без бактериальных осложнений применение антибиотиков бессмысленно — они никак не воздействуют на вирус). В безвыходной ситуации при угрозе неблагоприятного исхода в условиях реанимации возможно назначение средств, не имеющих достаточную доказательную базу, например некоторых препаратов для лечения малярии и перспективных противовирусных средств общевирусного спектра .

В виду повышенного риска тромбообразования при новой коронавирусной инфекции госпитализированным пациентам (у которых проводились исследования гемостаза) и больным коронавирусной инфекцией с хроническими заболеваниями сердечно-сосудистой системы показано назначение антитромботической терапии (или продолжение её приёма). У негоспитализированных лиц, у больных нетяжёлыми формами новой коронавирусной инфекции и у лиц без сопутствующей патологии (у которых не проводилось исследование гемостаза) назначение такой терапии не рекомендуется и может быть опасно. Предупреждение и лечение тромбооборазования и кровотечений имеет очень тонкую грань и в порыве помочь можно только навредить .

Применение ингибиторов ангиотензинпревращающего фермента, блокаторов рецепторов ангиотензина, статинов показано лишь тем людям, которые принимали их до болезни COVID-19, для лечения коронавирусной инфекции они не рекомендованы.

НПВС назначаются согласно общим основаниям их применения, приём кортикостероидов ограничивается лишь тяжёлыми случаями в реанимации или при сопутствующих показаниях . В настоящее время проводятся исследования эффективности и целесообразности применения плазмы выздоравливающих.